真菌性病害和细菌性病害是危害农作物的主要杀手，只有正确区别对症下药，才可起到事半功倍的防治效果，二者主要特征为：1.  真菌的菌体多数是丝状体，有细胞壁和细胞核；细菌外形杆状，多数有鞭毛，且长，2真菌的生殖方式为无性和有性繁殖方式而细菌为裂殖繁殖方式。
其病害主要区别是  ：真菌性病害是植物病害中发生程度最高、最常见的一种，可分为低等真菌性病害和高等真菌性病害；细菌性病害是植物病害中最少见的一种，但有许多细菌性病害对生产影响却很严重，造成大量减产或毁田；植物病毒性病害又称花叶病，发生程度仅次于真菌性病害。
      真菌性病害：
    1、主要种类：黑粉病、白粉病、锈病、霜霉病、菌核病等。蔬菜上常见的有茄子黄萎病、瓜类白粉病、霜霉病；大田作物上如向日葵菌核病，西瓜、水稻的三大病害等。
    2、主要症状
    发生真菌性病害的植株上一般都产生白粉层、黑粉层、霜霉层、锈孢子堆、菌核等，若在病株上看见上述特征之一，可先初步判断为真菌性病害。
    细菌性病害
    1、主要种类：十字花科软腐病、茄科青枯病、马铃薯环腐病、水稻叶枯病。
    2、主要症状：细菌通过植株的气孔、伤口等处侵入，发病后的植株一般表现为坏死、腐烂或萎蔫。